RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 PDE4BQ07343 736 aa35.94■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 SLFN13Q68D06 897 aa35.94■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 GMCL1Q96IK5 515 aa35.94■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM39AQ9NV64 488 aa35.94■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa35.94■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa35.93■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 ERC2O15083 957 aa35.93■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 FOXP2O15409 715 aa35.93■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 GJA9P57773 515 aa35.93■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD35Q8N283 1001 aa35.93■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 TBX21Q9UL17 535 aa35.93■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF536O15090 1300 aa35.92■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM265A0A087WTH1 108 aa35.92■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 PLA2G6O60733 806 aa35.92■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 TSPY3P0CV98 308 aa35.92■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 TSPY8P0CW00 308 aa35.92■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 PPARAQ07869 468 aa35.92■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 FAM133AQ8N9E0 248 aa35.92■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 SALL3Q9BXA9 1300 aa35.91■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 DCDC2CA8MYV0 355 aa35.91■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 FPGSQ05932 587 aa35.91■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC144BQ3MJ40 725 aa35.91■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 ARMCX2Q7L311 632 aa35.91■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP35.91■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 CTAGE5O15320 804 aa35.9■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 STAT2P52630 851 aa35.9■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 TFAP4Q01664 338 aa35.9■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 NAPBQ9H115 298 aa35.9■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM232C9JQI7 657 aa35.89■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 FAM160B2Q86V87 743 aa35.89■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
ALYREF-202ENST00000505490 MROH7Q68CQ1 1323 aa35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 TIMP1P01033 207 aa35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 ASGR1P07306 291 aa35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 NOVP48745 357 aa35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 SLC4A3P48751 1232 aa35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 STAG1Q8WVM7 1258 aa35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 GLT1D1Q96MS3 346 aa35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 CNTN2Q02246 1040 aa35.87■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 CHURC1Q8WUH1 139 aa35.87■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 ACAD9Q9H845 621 aa35.87■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 TKFCQ3LXA3 575 aa35.86■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa35.86■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 FSD1Q9BTV5 496 aa35.86■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 IL17RBQ9NRM6 502 aa35.86■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC37A2A6NM11 1700 aa35.86■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 MFSD5Q6N075 450 aa35.85■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 SPC25Q9HBM1 224 aa35.85■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 SLC1A4P43007 532 aa35.84■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 AGBL1Q96MI9 1066 aa35.84■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 ANAPC4Q9UJX5 808 aa35.84■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 SOWAHBA6NEL2 793 aa35.83■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 ARVCFO00192 962 aa35.83■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 MX1P20591 662 aa35.83■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 HOMER2Q9NSB8 354 aa35.83■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 RNF146Q9NTX7 359 aa35.83■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 LCTP09848 1927 aa35.83■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 ASTN1O14525 1302 aa35.83■■■■□ 3.33
ALYREF-202ENST00000505490 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 FGRP09769 529 aa35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 MCCP23508 829 aa35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 GNASQ5JWF2 1037 aa35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 RASIP1Q5U651 963 aa35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 RCSD1Q6JBY9 416 aa35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 FAM126BQ8IXS8 530 aa35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 MYLIPQ8WY64 445 aa35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 C16orf59Q7L2K0 433 aa35.81■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 SLC43A3Q8NBI5 491 aa35.81■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.323e-7■■■■□ 23.3
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ALYREF-202ENST00000505490 ASB14A6NK59 587 aa35.79■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 CD4P01730 458 aa35.79■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa35.79■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 TRERF1Q96PN7 1200 aa35.79■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 INCENPQ9NQS7 918 aa35.79■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 PRR12Q9ULL5 1215 aa35.79■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 TNFAIP2Q03169 654 aa35.78■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 STX8Q9UNK0 236 aa35.78■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 TSPY2A6NKD2 308 aa35.77■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 ORC4O43929 436 aa35.77■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 NMT2O60551 498 aa35.77■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 CTDSPL2Q05D32 466 aa35.77■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 ALX1Q15699 326 aa35.77■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM240Q5SV17 173 aa35.77■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 KCTD1Q719H9 257 aa35.77■■■■□ 3.32
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