RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 RNF146Q9NTX7 359 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 RIPK3Q9Y572 518 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 ATP2A1O14983 1001 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 PGK2P07205 417 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 TRIM32Q13049 653 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 KRT32Q14532 448 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.21■■□□□ 1.15
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PITX1-204ENST00000504936 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 FBXO40Q9UH90 709 aa22.21■■□□□ 1.15
PITX1-204ENST00000504936 CCDC69A6NI79 296 aa22.2■■□□□ 1.14
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PITX1-204ENST00000504936 CHST13Q8NET6 341 aa22.2■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 ACAD9Q9H845 621 aa22.2■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 SENP2Q9HC62 589 aa22.2■■□□□ 1.14
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PITX1-204ENST00000504936 TMEM87BQ96K49 555 aa22.19■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.19■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.19■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 ZNF536O15090 1300 aa22.18■■□□□ 1.14
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PITX1-204ENST00000504936 RASEFQ8IZ41 740 aa22.18■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
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PITX1-204ENST00000504936 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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PITX1-204ENST00000504936 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.16■■□□□ 1.14
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PITX1-204ENST00000504936 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.15■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.15■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.15■■□□□ 1.14
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PITX1-204ENST00000504936 MTA3Q9BTC8 594 aa22.15■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.15■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 PNMA2Q9UL42 364 aa22.15■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.15■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 PFASO15067 1338 aa22.14■■□□□ 1.14
PITX1-204ENST00000504936 POTEB2H3BUK9 544 aa22.14■■□□□ 1.13
PITX1-204ENST00000504936 DDAH1O94760 285 aa22.14■■□□□ 1.13
PITX1-204ENST00000504936 GJB1P08034 283 aa22.14■■□□□ 1.13
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PITX1-204ENST00000504936 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.14■■□□□ 1.13
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PITX1-204ENST00000504936 HOMER1Q86YM7 354 aa22.14■■□□□ 1.13
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PITX1-204ENST00000504936 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.14■■□□□ 1.13
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PITX1-204ENST00000504936 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.13■■□□□ 1.13
PITX1-204ENST00000504936 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PITX1-204ENST00000504936 TROAPQ12815 778 aa22.12■■□□□ 1.13
PITX1-204ENST00000504936 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.12■■□□□ 1.13
PITX1-204ENST00000504936 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.12■■□□□ 1.13
PITX1-204ENST00000504936 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PITX1-204ENST00000504936 CALM1P0DP23 149 aa22.11■■□□□ 1.13
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