RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.27□□□□□ -0.12
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RABGEF1-211ENST00000503687 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 GOPCQ9HD26 462 aa14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.27□□□□□ -0.13
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RABGEF1-211ENST00000503687 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.26□□□□□ -0.13
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RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.26□□□□□ -0.13
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RABGEF1-211ENST00000503687 STK36Q9NRP7 1315 aa14.26□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 CAMTA2O94983 1202 aa14.26□□□□□ -0.13
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RABGEF1-211ENST00000503687 SLC1A4P43007 532 aa14.26□□□□□ -0.13
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RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.26□□□□□ -0.13
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RABGEF1-211ENST00000503687 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.23□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 POTEMA6NI47 508 aa14.23□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.23□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA0754O94854 1291 aa14.23□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 TXNRD1Q16881 649 aa14.23□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 DCCP43146 1447 aa14.23□□□□□ -0.13
RABGEF1-211ENST00000503687 NTSR2O95665 410 aa14.23□□□□□ -0.13
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