RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK32B	Q9NY57	414 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRGAP3	O43295	1099 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERPINB2	P05120	415 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP10	P09238	476 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCGRT	P55899	365 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTSW	P56202	376 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUCB1	Q02818	461 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC24	Q50LG9	513 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUP98	P52948	1817 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE8A	O60658	829 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGEF15	O94989	841 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPRA	P18433	802 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUDT8	Q8WV74	236 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC3B	Q9H195	1237 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	COPRS	Q9NQ92	184 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R082	166 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAP23	O00161	211 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCF3	P15923	654 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	DGKG	P49619	791 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	FANCC	Q00597	558 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K10	Q02779	954 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIL1	Q9H173	461 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	LILRB5	O75023	590 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB7A	O95365	584 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	NID1	P14543	1247 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRY2	Q49AN0	593 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	LNPK	Q9C0E8	428 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTL9	Q8NET4	1388 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	EYA2	O00167	538 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPHA1	P21709	976 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC27	P30260	824 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	TFCP2	Q12800	502 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNBD1	Q8NA66	436 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCC1	Q96CN9	775 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRP5	O75197	1615 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	TM4SF5	O14894	197 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMMR	O75330	724 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNA3	P22001	575 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRNA5	P30532	468 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	OLFM4	Q6UX06	510 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	NYX	Q9GZU5	481 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CASZ1	Q86V15	1759 aa		7.56	□□□□□ -1.2

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