RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489736.5

CP-211, Transcript of ceruloplasmin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CP, Length 1,756 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CP-211ENST00000489736 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 SMCHD1A6NHR9 2005 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 RLFQ13129 1914 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 IRF6O14896 467 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 TRAK2O60296 914 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 XBP1P17861 261 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 PTPAQ15257 358 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 MAP3K11Q16584 847 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 TREML2Q5T2D2 321 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 LDHDQ86WU2 507 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 RGS22Q8NE09 1264 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 SPATA32Q96LK8 384 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 ZMYND12Q9H0C1 365 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 GINM1Q9NU53 330 aa7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.4□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 ZNF536O15090 1300 aa7.4□□□□□ -1.22
CP-211ENST00000489736 USP17L15C9J2P7 530 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP17L11C9JVI0 530 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP17L18D6R9N7 530 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP17L22D6RA61 530 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP17L19D6RCP7 530 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP17L20D6RJB6 530 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 EDIL3O43854 480 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 DSG3P32926 999 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 NF2P35240 595 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 GRIN1Q05586 938 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP17L24Q0WX57 530 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ANO1Q5XXA6 986 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.4□□□□□ -1.23
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CP-211ENST00000489736 TBC1D5Q92609 795 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ATG4CQ96DT6 458 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 C12orf42Q96LP6 360 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 CSADQ9Y600 493 aa7.4□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ESYT2A0FGR8 921 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 FLOT1O75955 427 aa7.39□□□□□ -1.23
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CP-211ENST00000489736 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ADCY7P51828 1080 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 USP14P54578 494 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 MOGSQ13724 837 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ZNF174Q15697 407 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 INF2Q27J81 1249 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 CST9Q5W186 159 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 FBXO11Q86XK2 927 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 LPAR1Q92633 364 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 OPTNQ96CV9 577 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 FEM1BQ9UK73 627 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ELP1O95163 1332 aa7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 MEIS2O14770 477 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 LIG1P18858 919 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 CALML3P27482 149 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 STK38Q15208 465 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 TTC38Q5R3I4 469 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 FAM160B2Q86V87 743 aa7.38□□□□□ -1.23
CP-211ENST00000489736 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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