RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 EYSQ5T1H1 3165 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 ZNF536O15090 1300 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 ACLYP53396 1101 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 PDE1AP54750 535 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 ACVR2BQ13705 512 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 KCNA10Q16322 511 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 FAM227BQ96M60 508 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 STX8Q9UNK0 236 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 A0A0D9SFI3 127 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 TSPY2A6NKD2 308 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 POTEB2H3BUK9 544 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 IGHDP01880 384 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 STAT2P52630 851 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 EPHB4P54760 987 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 CCDC174Q6PII3 467 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 ARMCX2Q7L311 632 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 CHST13Q8NET6 341 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 GMCL1Q96IK5 515 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 GUCD1Q96NT3 240 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 LCTP09848 1927 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 CLTBP09497 229 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 PTGS1P23219 599 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 SLC1A4P43007 532 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 EVI5LQ96CN4 794 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 KATNBL1Q9H079 304 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 RNF146Q9NTX7 359 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-212ENST00000485532 ASTN1O14525 1302 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ALAS1P13196 640 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 OAZ1P54368 228 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 FAAP100Q0VG06 881 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 FAM160B2Q86V87 743 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 LNPKQ9C0E8 428 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ACAD9Q9H845 621 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 FBXO40Q9UH90 709 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 DLL1O00548 723 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 FGAP02671 866 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ASGR1P07306 291 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 SLC16A2P36021 539 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 TOMM22Q9NS69 142 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0355O15063 1070 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 CTAGE5O15320 804 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ORC4O43929 436 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 FDX1P10109 184 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 RAG1P15918 1043 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 NOVP48745 357 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 HAND2P61296 217 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 BEX3Q00994 111 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ALX1Q15699 326 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 CCDC96Q2M329 555 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-212ENST00000485532 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms