RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 FBXO40Q9UH90 709 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 ZNF536O15090 1300 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 MCM3APO60318 1980 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 GJA8P48165 433 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 CHST3Q7LGC8 479 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 CHST13Q8NET6 341 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 DEFB118Q96PH6 123 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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NELFE-208ENST00000481121 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 SHISA4Q96DD7 197 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 LCTP09848 1927 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 ANTXR2P58335 489 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 WTAPQ15007 396 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 MAML3Q96JK9 1138 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 ACAD9Q9H845 621 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 RNF146Q9NTX7 359 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-208ENST00000481121 ICAM1P05362 532 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 ALAS1P13196 640 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 CYP2C19P33261 490 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 TKFCQ3LXA3 575 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 DDX11Q96FC9 970 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 SGPL1O95470 568 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 MCM5P33992 734 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 PRC1O43663 620 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 CPVLQ9H3G5 476 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 REC8O95072 547 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 MTA3Q9BTC8 594 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 SENP2Q9HC62 589 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 IGHA2P01877 340 aa24.28■■□□□ 1.48
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NELFE-208ENST00000481121 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 CAPN2P17655 700 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 TMEM87BQ96K49 555 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 PNMA2Q9UL42 364 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 PFASO15067 1338 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 CYBAP13498 195 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 LY9Q9HBG7 655 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFE-208ENST00000481121 CNGA1P29973 690 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 TINF2Q9BSI4 451 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 KRT32Q14532 448 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 GRM4Q14833 912 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 NEK1Q96PY6 1258 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 KLRF2D3W0D1 207 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 RASEFQ8IZ41 740 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 TRPV1Q8NER1 839 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 POTEB2H3BUK9 544 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 MSCO60682 206 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 TROAPQ12815 778 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 USH1GQ495M9 461 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 NSMFQ6X4W1 530 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 CCDC69A6NI79 296 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 DDAH1O94760 285 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 HSPA4P34932 840 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.22■■□□□ 1.47
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