RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452612.5

TTC28-AS1-217, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 746 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CRBNQ96SW2 442 aa15.41■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FBXO40Q9UH90 709 aa15.41■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 STX8Q9UNK0 236 aa15.41■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.41■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ADCY6O43306 1168 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RAG1P15918 1043 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SNAP25P60880 206 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CNTN2Q02246 1040 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 VPS53Q5VIR6 699 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KCTD1Q719H9 257 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ARMCX2Q7L311 632 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ACAD9Q9H845 621 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LCTP09848 1927 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC174Q6PII3 467 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FAM160B2Q86V87 743 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CHURC1Q8WUH1 139 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 STAG1Q8WVM7 1258 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GMCL1Q96IK5 515 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RNF146Q9NTX7 359 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF536O15090 1300 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KIAA0355O15063 1070 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FDX1P10109 184 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ALAS1P13196 640 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EPHB4P54760 987 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FAAP100Q0VG06 881 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EVI5LQ96CN4 794 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ASGR1P07306 291 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PDE1AP54750 535 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC96Q2M329 555 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FAM133AQ8N9E0 248 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FAM227BQ96M60 508 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KATNBL1Q9H079 304 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SPC25Q9HBM1 224 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TOMM22Q9NS69 142 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GJA9P57773 515 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FPGSQ05932 587 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GNASQ5JWF2 1037 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TOX2Q96NM4 488 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 A0A0D9SFI3 127 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PTGS1P23219 599 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BEX3Q00994 111 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TKFCQ3LXA3 575 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ELP1O95163 1332 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MYO9BQ13459 2157 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CTAGE5O15320 804 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ORC4O43929 436 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PLA2G6O60733 806 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FGAP02671 866 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SLC16A2P36021 539 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HAND2P61296 217 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TNFAIP2Q03169 654 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NSMFQ6X4W1 530 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms