RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 E2F4Q16254 413 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 SPATA1Q5VX52 437 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 SPATA20Q8TB22 786 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 LRRC15Q8TF66 581 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 NELFBQ8WX92 580 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 STXBP3O00186 592 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 CALML3P27482 149 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 HSPA1LP34931 641 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 PRCPP42785 496 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 ZSCAN26Q16670 478 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 RREB1Q92766 1687 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 NR1I3Q14994 352 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 EFCC1Q9HA90 598 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 CASZ1Q86V15 1759 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TXLNAP40222 546 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 CARD6Q9BX69 1037 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TXKP42681 527 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 AKR1B1P15121 316 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 RHBDL3P58872 404 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 GSDMAQ96QA5 445 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 ABL1P00519 1130 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 BMP15O95972 392 aa23.41■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 KRT31Q15323 416 aa23.41■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.41■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 BARHL2Q9NY43 387 aa23.41■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 ARHGAP6O43182 974 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 CASQ1P31415 396 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TXNRD1Q16881 649 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 DISC1Q9NRI5 854 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 ATP2B4P23634 1241 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 PAK1Q13153 545 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 SOGA3Q5TF21 947 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 CERS5Q8N5B7 392 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TBCKQ8TEA7 893 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TFR2Q9UP52 801 aa23.4■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 A0A1B0GTH6 734 aa23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 LMAN1P49257 510 aa23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 UBE2SQ16763 222 aa23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 KCTD1Q719H9 257 aa23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 MNS1Q8NEH6 495 aa23.39■■□□□ 1.34
SPRN-201ENST00000414069 PPP4CP60510 307 aa23.39■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 POTEDQ86YR6 584 aa23.39■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 PLCG1P19174 1290 aa23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 NFIAQ12857 509 aa23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 FILIP1LQ4L180 1135 aa23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 SNAP25P60880 206 aa23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 ICE2Q659A1 982 aa23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SPRN-201ENST00000414069 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms