RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 SH2D4AQ9H788 454 aa26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 VCPKMTQ9H867 229 aa26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 HPSEQ9Y251 543 aa26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 ADCY7P51828 1080 aa26.1■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 INF2Q27J81 1249 aa26.09■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.09■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 DCAF15Q66K64 600 aa26.09■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 CTAGE5O15320 804 aa26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 ZNF202O95125 648 aa26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 MCM7P33993 719 aa26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 PTGDRQ13258 359 aa26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 GINM1Q9NU53 330 aa26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTX3-201ENST00000295927 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.08■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 HOOK2Q96ED9 719 aa26.08■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.08■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.08■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 SYKP43405 635 aa26.07■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
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PTX3-201ENST00000295927 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.07■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 DOCK1Q14185 1865 aa26.07■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 STAT2P52630 851 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 SNAP25P60880 206 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 FERMT2Q96AC1 680 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 CSRNP2Q9H175 543 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 TMEM260Q9NX78 707 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.06■■□□□ 1.76
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PTX3-201ENST00000295927 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 CUL5Q93034 780 aa26.05■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 SDF4Q9BRK5 362 aa26.05■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 PANK2Q9BZ23 570 aa26.05■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.05■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.05■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 RNF214Q8ND24 703 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 FEZ1Q99689 392 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 KCNH3Q9ULD8 1083 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
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PTX3-201ENST00000295927 TIGD1Q96MW7 591 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 AMNQ9BXJ7 453 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 UBE2SQ16763 222 aa26.03■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 FBXO11Q86XK2 927 aa26.03■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 TBCKQ8TEA7 893 aa26.03■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.03■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 NEK8Q86SG6 692 aa26.02■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.02■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 GPR162Q16538 588 aa26.02■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.02■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 WRNIP1Q96S55 665 aa26.02■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 FZD1Q9UP38 647 aa26.02■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.02■■□□□ 1.76
PTX3-201ENST00000295927 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.01■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 PLA2G6O60733 806 aa26.01■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 LETM2Q2VYF4 491 aa26.01■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.01■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP49Q70CQ1 688 aa26.01■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.01■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.01■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.01■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 IL17AQ16552 155 aa26■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USH1GQ495M9 461 aa26■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 FAM160B2Q86V87 743 aa26■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 FEM1BQ9UK73 627 aa26■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.99■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 LONRF3Q496Y0 759 aa25.99■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 KIFC2Q96AC6 838 aa25.99■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.99■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 LPAR1Q92633 364 aa25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 EPSTI1Q96J88 318 aa25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.98■■□□□ 1.75
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