RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.95■■□□□ 1.1
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IFRD1-201ENST00000005558 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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IFRD1-201ENST00000005558 USP14P54578 494 aa21.92■■□□□ 1.1
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IFRD1-201ENST00000005558 FAM160B2Q86V87 743 aa21.92■■□□□ 1.1
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IFRD1-201ENST00000005558 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 USP17L19D6RCP7 530 aa21.87■■□□□ 1.09
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IFRD1-201ENST00000005558 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 GRIN1Q05586 938 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 USP17L24Q0WX57 530 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 STK38Q15208 465 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.87■■□□□ 1.09
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