RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP21A2P08686 494 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP2D6P10635 497 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-214ENST00000592483 CYBAP13498 195 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-214ENST00000592483 ANAPC15P60006 121 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-214ENST00000592483 GABPAQ06546 454 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE4BQ07343 736 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT32Q14532 448 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-214ENST00000592483 TSGA10IPQ3SY00 556 aa27.83■■■□□ 2.05
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CAPNS1-214ENST00000592483 C16orf86Q6ZW13 317 aa27.83■■■□□ 2.05
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CAPNS1-214ENST00000592483 STAG1Q8WVM7 1258 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 ASB2Q96Q27 587 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 FGRP09769 529 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJB2P25686 324 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 AKNAD1Q5T1N1 836 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF576Q9H609 170 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 SIPA1L1O43166 1804 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 EPHB4P54760 987 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 HAND2P61296 217 aa27.8■■■□□ 2.04
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CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L22D6RA61 530 aa27.79■■■□□ 2.04
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CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L19D6RCP7 530 aa27.79■■■□□ 2.04
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CAPNS1-214ENST00000592483 ADCYAP1R1P41586 468 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 TLE2Q04725 743 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L24Q0WX57 530 aa27.79■■■□□ 2.04
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CAPNS1-214ENST00000592483 IL17RAQ96F46 866 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJC18Q9H819 358 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.79■■■□□ 2.04
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CAPNS1-214ENST00000592483 C12orf42Q96LP6 360 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT23Q9C075 422 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-214ENST00000592483 E7EWF7 191 aa27.76■■■□□ 2.03
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CAPNS1-214ENST00000592483 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC17Q96LX7 622 aa27.76■■■□□ 2.03
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CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.74■■■□□ 2.03
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CAPNS1-214ENST00000592483 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 RAG1P15918 1043 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 EVX2Q03828 476 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 IL27Q8NEV9 243 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO9BQ13459 2157 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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