RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLA2G6O60733 806 aa24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 REPS2Q8NFH8 660 aa24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCNA1P78396 465 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBED4O75132 1171 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNAP25P60880 206 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPVLQ9H3G5 476 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNRH1P01148 92 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR78Q5VTH9 848 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPXCR1Q8N123 301 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMA5P28066 241 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAPK4P31152 587 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAT3P40763 770 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 LIFRP42702 1097 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMTC2Q8N394 836 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 COA7Q96BR5 231 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYL10Q9BUA6 226 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRRDQ9UH36 339 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 GABRQQ9UN88 632 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC69A6NI79 296 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXD10P28358 340 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC4A3P48751 1232 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKCZQ05513 592 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 TROAPQ12815 778 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR142Q7Z601 462 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERCC3P19447 782 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPS6KB1P23443 525 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLXNB2O15031 1838 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 HTTP42858 3142 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 FDX1P10109 184 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRM4Q14833 912 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC174Q6PII3 467 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGD1P98174 961 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 Q6ZUG5 572 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIPK3Q9Y572 518 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP2A1O14983 1001 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 RXRAP19793 462 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 FLT3LGP49771 235 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 RUFY3Q7L099 469 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNS4Q8IZW8 715 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJD2Q9UKL4 321 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF536O15090 1300 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLRF2D3W0D1 207 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDAH1O94760 285 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC25A27O95847 323 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 MROH8Q9H579 483 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 OAZ1P54368 228 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRMT2P55345 433 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANAPC15P60006 121 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms