RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525778.5

SOGA3-203, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 4,077 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-203ENST00000525778 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ESYT3A0FGR9 886 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 SEMA3EO15041 775 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 GRIN1Q05586 938 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 KRT13P13646 458 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 GNAT2P19087 354 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 KLC4Q9NSK0 619 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 STX8Q9UNK0 236 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CALM1P0DP23 149 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CALM2P0DP24 149 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CALM3P0DP25 149 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 EHHADHQ08426 723 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TSKSQ9UJT2 592 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 KCNA6P17658 529 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 RPS6KA1Q15418 735 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 MB21D1Q8N884 522 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 GPR108Q9NPR9 543 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TRAF5O00463 557 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 DEPDC5O75140 1603 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 A0A0U1RQJ8 604 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 KCNK3O14649 394 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ITGA6P23229 1130 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 WDR93Q6P2C0 686 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 OXER1Q8TDS5 423 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC25Q86WR0 208 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ZBED6P86452 979 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 KAZALD1Q96I82 304 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 UBE4AQ14139 1066 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 LETM2Q2VYF4 491 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 DCAF5Q96JK2 942 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ATF3P18847 181 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC63Q8NA47 563 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 EHD4Q9H223 541 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CD248Q9HCU0 757 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 HPSEQ9Y251 543 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 KRT14P02533 472 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CUL4BQ13620 913 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ERBB3P21860 1342 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ALKQ9UM73 1620 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ELF1P32519 619 aa20.02■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.02■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.02■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 ANO9A1A5B4 782 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 PCK1P35558 622 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 DYMQ7RTS9 669 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 TNKSO95271 1327 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 PTPAQ15257 358 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 DAAM2Q86T65 1068 aa20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-203ENST00000525778 INTS13Q9NVM9 706 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms