RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521993.2

ERLIN2-209, Transcript of ER lipid raft associated 2, human

TSL 3

Gene ERLIN2, Length 764 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERLIN2-209	ENST00000521993	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	FAM122A	Q96E09	287 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	TBX21	Q9UL17	535 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	NCOR1	O75376	2440 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	VWA5A	O00534	786 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	PBX2	P40425	430 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CDK7	P50613	346 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	RAB30	Q15771	203 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	AKR1B1	P15121	316 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CSF2RA	P15509	400 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	PDE6A	P16499	860 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	IGFBP4	P22692	258 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF365	Q70YC5	407 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	SPC25	Q9HBM1	224 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993		A0A0G2JMZ2	1700 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	EYS	Q5T1H1	3165 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	ARVCF	O00192	962 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CYP2D6	P10635	497 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	EVX2	Q03828	476 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	ADGRE1	Q14246	886 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	AACS	Q86V21	672 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	CDH23	Q9H251	3354 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ERLIN2-209	ENST00000521993	APBB1	O00213	710 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	FGB	P02675	491 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	ASGR1	P07306	291 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	HERVK_113	Q902F9	699 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	IL23A	Q9NPF7	189 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	RAD21	O60216	631 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	ACR	P10323	421 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	CDK8	P49336	464 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	GJA9	P57773	515 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
ERLIN2-209	ENST00000521993	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		11.82	□□□□□ -0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.6 ms