RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 HOXD10P28358 340 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SMARCA1P28370 1054 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 GNGT1P63211 74 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CNGA3Q16281 694 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PRAM1Q96QH2 718 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCB6Q9NP58 842 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ANO10Q9NW15 660 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PDE4BQ07343 736 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MYO1EQ12965 1108 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 RIPK1Q13546 671 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC15A2Q16348 729 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 FXNQ16595 210 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF365Q70YC5 407 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CNKSR1Q969H4 720 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MPP4Q96JB8 637 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SYNCQ9H7C4 482 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 HOXC10Q9NYD6 342 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 DKK3Q9UBP4 350 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP10DQ9P241 1426 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 BICDL2A1A5D9 508 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PRC1O43663 620 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 FLOT1O75955 427 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ANP32DO95626 131 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 OXCT1P55809 520 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MSL1Q68DK7 614 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGAP18Q8N392 663 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MAML3Q96JK9 1138 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 VCXQ9H320 206 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 NOD2Q9HC29 1040 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM247A6NEH6 219 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP9BO43861 1147 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MLH1P40692 756 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CCT8P50990 548 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PAPPAQ13219 1627 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 XRCC4Q13426 336 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 EMC10Q5UCC4 262 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM228AQ86W67 206 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC43Q8N309 656 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PDILTQ8N807 584 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 HVCN1Q96D96 273 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 C2CD2Q9Y426 696 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MGEA5O60502 916 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PEX14O75381 377 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP6V1G2O95670 118 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CLCN2P51788 898 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 STIM1Q13586 685 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TXNRD1Q16881 649 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CFAP157Q5JU67 520 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms