RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 ANO9A1A5B4 782 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 CDK17Q00537 523 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 COBLL1Q53SF7 1204 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 ADSSL1Q8N142 457 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 CCSER1Q9C0I3 900 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 MYO6Q9UM54 1294 aa18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 DNM2P50570 870 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 STX17P56962 302 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 NLRP5P59047 1200 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 ERVK-24P63145 666 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF174Q15697 407 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 FIGNQ5HY92 759 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 IQCEQ6IPM2 695 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC170Q8IYT3 715 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 AK8Q96MA6 479 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 CAPN11Q9UMQ6 739 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 CASZ1Q86V15 1759 aa18.96■□□□□ 0.63
HCLS1-202ENST00000428394 FAM205CA6NFA0 338 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ERICH4A6NGS2 130 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 PSMA7O14818 248 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 NDUFA10O95299 355 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 KRT9P35527 623 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 MEA1Q16626 185 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 HSP90B2PQ58FF3 399 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 CTR9Q6PD62 1173 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 DGKHQ86XP1 1220 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 LZTS2Q9BRK4 669 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ADAM21Q9UKJ8 722 aa18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 BICDL2A1A5D9 508 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 RHOBTB3O94955 611 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 STAT6P42226 847 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 BLIDQ8IZY5 108 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 MB21D1Q8N884 522 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 DISC1Q9NRI5 854 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 USP21Q9UK80 565 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.94■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PQJ5 194 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ITIH3Q06033 890 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 VPS72Q15906 364 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 PTPN21Q16825 1174 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 CPLX3Q8WVH0 158 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 KRT86O43790 486 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ACTN2P35609 894 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 UBXN1Q04323 297 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 FOXR2Q6PJQ5 311 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 CERS3Q8IU89 383 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ABCF2Q9UG63 623 aa18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 MYH1P12882 1939 aa18.92■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ABCB11O95342 1321 aa18.92■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN26Q16670 478 aa18.92■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.92■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.92■□□□□ 0.62
HCLS1-202ENST00000428394 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms