RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 EHMT1Q9H9B1 1298 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 INSRRP14616 1297 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ARSHQ5FYA8 562 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SLFN12Q8IYM2 578 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 IRAK3Q9Y616 596 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 FGRP09769 529 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PDE6BP35913 854 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PLP2Q04941 152 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 MLECQ14165 292 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SNX17Q15036 470 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 GINM1Q9NU53 330 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PPT2Q9UMR5 302 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ATP2B1P20020 1258 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 NR0B2Q15466 257 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 MCF2L2Q86YR7 1114 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SPPL2CQ8IUH8 684 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJB8Q8NHS0 232 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 KIF2CQ99661 725 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 GCM1Q9NP62 436 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 GMIPQ9P107 970 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CBX7O95931 251 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ESR1P03372 595 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SOX9P48436 509 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SSPNQ14714 243 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC81Q6ZN84 652 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ATG4CQ96DT6 458 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SRRDQ9UH36 339 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 RAG1P15918 1043 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PI3P19957 117 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 GBP1P32455 592 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CREG2Q8IUH2 290 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 FEZF2Q8TBJ5 459 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ZNRF3Q9ULT6 936 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CHRNEQ04844 493 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CDCP2Q5VXM1 449 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 CNNM2Q9H8M5 875 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 HRKO00198 91 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 RGS13O14921 159 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 UBOX5O94941 541 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 NME1P15531 152 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ETV3P41162 512 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 NASPP49321 788 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 LRRN2O75325 713 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 RBL2Q08999 1139 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SGPP1Q9BX95 441 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ADAMTS20P59510 1910 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 OR14I1A6ND48 311 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 IMPDH2P12268 514 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 TNK2Q07912 1038 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SOGA3Q5TF21 947 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 Q96M66 194 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SLC9A7Q96T83 725 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 BDH2Q9BUT1 245 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 C19orf44Q9H6X5 657 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SP110Q9HB58 689 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ACRP10323 421 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms