RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 CCDC183Q5T5S1 534 aa28.07■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 RRAGCQ9HB90 399 aa28.07■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 GPCPD1Q9NPB8 672 aa28.07■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 TCHHQ07283 1943 aa28.07■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 F5H6K3 240 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 CTIFO43310 598 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 DEXIO95424 95 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 KLRC3Q07444 240 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 KCTD1Q719H9 257 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 SHISA4Q96DD7 197 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 HOOK2Q96ED9 719 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 UBA5Q9GZZ9 404 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 ZNF543Q08ER8 600 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 SLFN13Q68D06 897 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 KLRG1Q96E93 195 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 GNAQP50148 359 aa28.05■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 TTBK2Q6IQ55 1244 aa28.05■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.05■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 NDUFB10O96000 172 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 TMX2Q9Y320 296 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 CCDC96Q2M329 555 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 ASPRV1Q53RT3 343 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 CDCA5Q96FF9 252 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 OTOFQ9HC10 1997 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 KIAA1524Q8TCG1 905 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 TSC1Q92574 1164 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 USP25Q9UHP3 1055 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 KRT40Q6A162 431 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 FAM173BQ6P4H8 233 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.02■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 SLC1A4P43007 532 aa28.02■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.02■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 VAT1LQ9HCJ6 419 aa28.02■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 PHIPQ8WWQ0 1821 aa28.01■■■□□ 2.08
CTU1-201ENST00000421832 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 SLC16A2P36021 539 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 SCYL3Q8IZE3 742 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 WASF1Q92558 559 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 LZTS2Q9BRK4 669 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 OGFRQ9NZT2 677 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 RESTQ13127 1097 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 DCAF4Q8WV16 495 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 KCNJ14Q9UNX9 436 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 GMCL1Q96IK5 515 aa27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 SCG2P13521 617 aa27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 DGKZQ13574 1117 aa27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa27.99■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 KIF28PB7ZC32 967 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 MOB2Q70IA6 237 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 HOMER1Q86YM7 354 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 PIGSQ96S52 555 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 GINM1Q9NU53 330 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 PTPRAP18433 802 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 VCPKMTQ9H867 229 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 TRAF5O00463 557 aa27.97■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 SMARCA1P28370 1054 aa27.97■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.97■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 JMJD4Q9H9V9 463 aa27.97■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 GOPCQ9HD26 462 aa27.97■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa27.96■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 PICK1Q9NRD5 415 aa27.96■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 BMP3P12645 472 aa27.96■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 TRIM29Q14134 588 aa27.96■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 USP17L10C9JJH3 530 aa27.95■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 VGLL4Q14135 290 aa27.95■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.95■■■□□ 2.07
CTU1-201ENST00000421832 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms