RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391230.1

SNORD66.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 66, humanhuman

BASIC

Gene SNORD66, Length 76 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD66.1-201ENST00000391230 RNF214Q8ND24 703 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ACER1Q8TDN7 264 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 DCAF4Q8WV16 495 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 COA7Q96BR5 231 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTMR8Q96EF0 704 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 TEPSINQ96N21 525 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 BARHL2Q9NY43 387 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 HPSEQ9Y251 543 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 MYH1P12882 1939 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 KIF13BQ9NQT8 1826 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF541Q9H0D2 1346 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ESYT2A0FGR8 921 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 PHF20L1A8MW92 1017 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 H7C1D1 291 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 CTAGE5O15320 804 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 RAD21O60216 631 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 NDUFB10O96000 172 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 PFKFB1P16118 471 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 CAP2P40123 477 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 EPS15P42566 896 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ECE1P42892 770 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC1A4P43007 532 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRAPPC10P48553 1259 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 TNNI2P48788 182 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 NAPAP54920 295 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 SNAP25P60880 206 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 TYRO3Q06418 890 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 IL17AQ16552 155 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 UVSSAQ2YD98 709 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 USP49Q70CQ1 688 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 SDF4Q9BRK5 362 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 SYT17Q9BSW7 474 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 C6orf50Q9HD87 102 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 TMEM260Q9NX78 707 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 HACL1Q9UJ83 578 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 NAV1Q8NEY1 1877 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 LAMB1P07942 1786 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 DLEC1Q9Y238 1755 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 A0A087WWV3 80 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 TMEM232C9JQI7 657 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZBTB5O15062 677 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 KINO60870 393 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 BMP15O95972 392 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC192P0DO97 292 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 BMP3P12645 472 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 LMNB1P20700 586 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 GNA11P29992 359 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 MCM7P33993 719 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 SYKP43405 635 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 PTGDRQ13258 359 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 INF2Q27J81 1249 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 LONRF3Q496Y0 759 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 ILDR2Q71H61 639 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC148Q8NFR7 591 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRPM4Q8TD43 1214 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 EPSTI1Q96J88 318 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 TIGD1Q96MW7 591 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 CSRNP2Q9H175 543 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD66.1-201ENST00000391230 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms