RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	MS4A1	P11836	297 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	PGK2	P07205	417 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	FCER1A	P12319	257 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SNX17	Q15036	470 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	LRRC41	Q15345	812 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SLC25A27	O95847	323 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SHH	Q15465	462 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	BAD	Q92934	168 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	MMP19	Q99542	508 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	VWA5A	O00534	786 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	RAD21	O60216	631 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	PGK1	P00558	417 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	STAT3	P40763	770 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	RARB	P10826	455 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	RASA1	P20936	1047 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	ITGB8	P26012	769 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	TLE2	Q04725	743 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	KCTD2	Q14681	263 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909		A0A1W2PQY0	241 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	EPHB4	P54760	987 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909		F5H6K3	240 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	NDUFB10	O96000	172 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	CLTB	P09497	229 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	AKR1A1	P14550	325 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	COPB2	P35606	906 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	KLRC3	Q07444	240 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS5-208	ENST00000599909	RNF180	Q86T96	592 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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