RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMP3P12645 472 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC1A4P43007 532 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEC23AQ15436 765 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKS1AQ92625 1134 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERO1AQ96HE7 468 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 GMCL1Q96IK5 515 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 DSG3P32926 999 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNB2Q92953 911 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATG4CQ96DT6 458 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 KAT14Q9H8E8 782 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 MGAMO43451 1857 aa24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTGFP29279 349 aa24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 LBX2Q6XYB7 198 aa24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCTD1Q719H9 257 aa24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNMDO75829 334 aa24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCM5P33992 734 aa24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 Q3C1V9 767 aa24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNMA1Q8ND90 353 aa24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEK1Q96PY6 1258 aa24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 BTBD7Q9P203 1132 aa24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERICH2A1L162 156 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM232C9JQI7 657 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRC1O43663 620 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF22Q14807 665 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCAF4Q8WV16 495 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 SENP2Q9HC62 589 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYPNQ86TC9 1320 aa24.58■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEC24BO95487 1268 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDHBP11177 359 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMC4P43686 418 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERVK-9P63128 1117 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERVK-24P63145 666 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT32Q14532 448 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC96Q2M329 555 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 FEM1BQ9UK73 627 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 WTAPQ15007 396 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 C8orf34Q49A92 452 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIFC2Q96AC6 838 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM47Q96LD4 638 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 EFCC1Q9HA90 598 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM17Q9Y577 477 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 VWA5AO00534 786 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAT2P52630 851 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNHG28P0DPA3 235 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 MB21D1Q8N884 522 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPA1P15085 419 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 FCGRTP55899 365 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF543Q08ER8 600 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLS1Q14651 629 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM87BQ96K49 555 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 PORCNQ9H237 461 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 LY9Q9HBG7 655 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC16A2P36021 539 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF6Q15052 776 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM160B2Q86V87 743 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTA3Q9BTC8 594 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.52■■□□□ 1.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms