RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.51■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.51■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.51■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 NDUFB10O96000 172 aa23.5■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 HMGCRP04035 888 aa23.5■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 INHAP05111 366 aa23.5■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 ELNP15502 786 aa23.5■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 RGS2P41220 211 aa23.5■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.5■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 ATG4CQ96DT6 458 aa23.5■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.5■■□□□ 1.35
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CMTM3-211ENST00000565922 ZNF213O14771 459 aa23.49■■□□□ 1.35
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CMTM3-211ENST00000565922 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.49■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.49■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 STX8Q9UNK0 236 aa23.49■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.48■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 CAPN2P17655 700 aa23.48■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 CYP2B6P20813 491 aa23.48■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 HAND2P61296 217 aa23.48■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 PLS1Q14651 629 aa23.48■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 MTFR1Q15390 333 aa23.48■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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CMTM3-211ENST00000565922 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.48■■□□□ 1.35
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CMTM3-211ENST00000565922 RNF208Q9H0X6 261 aa23.48■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 MROH8Q9H579 483 aa23.48■■□□□ 1.35
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CMTM3-211ENST00000565922 STRNO43815 780 aa23.47■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 PTPREP23469 700 aa23.47■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 COPB2P35606 906 aa23.47■■□□□ 1.35
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CMTM3-211ENST00000565922 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.47■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 SLC25A27O95847 323 aa23.46■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 NEFLP07196 543 aa23.46■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 GJB1P08034 283 aa23.46■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 MAP2K5Q13163 448 aa23.46■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 SLFN13Q68D06 897 aa23.46■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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CMTM3-211ENST00000565922 INCENPQ9NQS7 918 aa23.46■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 FEM1BQ9UK73 627 aa23.46■■□□□ 1.35
CMTM3-211ENST00000565922 VWA5AO00534 786 aa23.45■■□□□ 1.34
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CMTM3-211ENST00000565922 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 GRB14Q14449 540 aa23.45■■□□□ 1.34
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CMTM3-211ENST00000565922 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.45■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.45■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.45■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 ERCC3P19447 782 aa23.44■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 CHMLP26374 656 aa23.44■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.44■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.44■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 GMCL1Q96IK5 515 aa23.44■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.44■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.44■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 RPTORQ8N122 1335 aa23.43■■□□□ 1.34
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CMTM3-211ENST00000565922 SLC1A4P43007 532 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 GJA8P48165 433 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 NOVP48745 357 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 TRIB2Q92519 343 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 NMT2O60551 498 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 ZBED4O75132 1171 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 HOXC6P09630 235 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 STAT3P40763 770 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 STAT2P52630 851 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 FAM160B2Q86V87 743 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 NBPF3Q9H094 633 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 BRCA2P51587 3418 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 DPP9Q86TI2 863 aa23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 IQCA1Q86XH1 822 aa23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 TTC14Q96N46 770 aa23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-211ENST00000565922 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.346e-8■■■■■ 50.5
CMTM3-211ENST00000565922 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.41■■□□□ 1.34
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