RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527225.1

SPCS2-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPCS2, Length 321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2-204ENST00000527225 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPCS2-204ENST00000527225 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.33■□□□□ 0.85
SPCS2-204ENST00000527225 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.33■□□□□ 0.85
SPCS2-204ENST00000527225 F5H6K3 240 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 KLRC3Q07444 240 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 TRIM32Q13049 653 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 GRB14Q14449 540 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 MKL1Q969V6 931 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 STRNO43815 780 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 TTLL1O95922 423 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 SDSP20132 328 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 TFAP4Q01664 338 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 PLS1Q14651 629 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 CEP290O15078 2479 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 NDUFB10O96000 172 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 HOXC6P09630 235 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 ERCC3P19447 782 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 CCL14Q16627 93 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 MROH8Q9H579 483 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 ZMYM6O95789 1325 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 VWA5AO00534 786 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 FGAP02671 866 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 TSPY2A6NKD2 308 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 HIP1O00291 1037 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 SLC25A27O95847 323 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 LAMA4Q16363 1823 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 FGRP09769 529 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 ADORA2AP29274 412 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 DPP9Q86TI2 863 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 REPS2Q8NFH8 660 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 INCENPQ9NQS7 918 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS2-204ENST00000527225 ORC4O43929 436 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 STAT3P40763 770 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 PDE4AP27815 886 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 COPB2P35606 906 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 SLFN13Q68D06 897 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 STX8Q9UNK0 236 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 ALPK3Q96L96 1907 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 FCER1AP12319 257 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 TOMM22Q9NS69 142 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 FEM1BQ9UK73 627 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 COBLO75128 1261 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 IGHA2P01877 340 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 BMP3P12645 472 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 TTC22Q5TAA0 569 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 DPF3Q92784 378 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 GMCL1Q96IK5 515 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 NMT2O60551 498 aa20.22■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 ZBED4O75132 1171 aa20.22■□□□□ 0.83
SPCS2-204ENST00000527225 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms