RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517246.1

RNA5SP415-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 415, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP415, Length 115 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP415-201ENST00000517246 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.5■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.5■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 FAM227BQ96M60 508 aa20.5■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.5■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.5■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 F5H6K3 240 aa20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 KLRC3Q07444 240 aa20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 CEP95Q96GE4 821 aa20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.49■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 A0A0D9SFI3 127 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 H0YGN5 161 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 NDUFB10O96000 172 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 HOXC6P09630 235 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 RILPL2Q969X0 211 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 INCENPQ9NQS7 918 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 VWA5AO00534 786 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 STRNO43815 780 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 TSPY3P0CV98 308 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 TSPY8P0CW00 308 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 ADORA2AP29274 412 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 TFAP4Q01664 338 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 DPP9Q86TI2 863 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 MKL1Q969V6 931 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 MROH8Q9H579 483 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 TTLL1O95922 423 aa20.46■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 ALX1Q15699 326 aa20.46■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.46■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.46■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.46■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.46■□□□□ 0.87
RNA5SP415-201ENST00000517246 COBLO75128 1261 aa20.45■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.45■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 TICAM2Q86XR7 235 aa20.45■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.45■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 REPS2Q8NFH8 660 aa20.45■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.45■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.45■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 ALPK3Q96L96 1907 aa20.45■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLC25A27O95847 323 aa20.44■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 CYP2C19P33261 490 aa20.44■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 STAT3P40763 770 aa20.44■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 LHX8Q68G74 356 aa20.44■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.44■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.44■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 IGHA2P01877 340 aa20.43■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 FGAP02671 866 aa20.43■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 FCER1AP12319 257 aa20.43■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 SDSP20132 328 aa20.43■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLFN13Q68D06 897 aa20.43■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.43■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 TSPY2A6NKD2 308 aa20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 TRPV1Q8NER1 839 aa20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 MMP19Q99542 508 aa20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 NBPF3Q9H094 633 aa20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 NMT2O60551 498 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLC34A2O95436 690 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 CNGA1P29973 690 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 KIFC2Q96AC6 838 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.41■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 ORC4O43929 436 aa20.4■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 EVI5O60447 810 aa20.4■□□□□ 0.86
RNA5SP415-201ENST00000517246 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms