RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 MKL1Q969V6 931 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-204ENST00000452765 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.2■■□□□ 1.46
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SH3BP2-204ENST00000452765 SNHG28P0DPA3 235 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-204ENST00000452765 DGKZQ13574 1117 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC96Q2M329 555 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-204ENST00000452765 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-204ENST00000452765 F5H6K3 240 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-204ENST00000452765 KLRC3Q07444 240 aa24.19■■□□□ 1.46
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SH3BP2-204ENST00000452765 FIBPO43427 364 aa24.19■■□□□ 1.46
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SH3BP2-204ENST00000452765 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.18■■□□□ 1.46
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SH3BP2-204ENST00000452765 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.17■■□□□ 1.46
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SH3BP2-204ENST00000452765 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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SH3BP2-204ENST00000452765 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.14■■□□□ 1.46
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.14■■□□□ 1.46
SH3BP2-204ENST00000452765 USP17L10C9JJH3 530 aa24.14■■□□□ 1.45
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SH3BP2-204ENST00000452765 MOB2Q70IA6 237 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.14■■□□□ 1.45
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SH3BP2-204ENST00000452765 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.14■■□□□ 1.45
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SH3BP2-204ENST00000452765 DCAF15Q66K64 600 aa24.13■■□□□ 1.45
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.12■■□□□ 1.45
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SH3BP2-204ENST00000452765 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.11■■□□□ 1.45
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SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.1■■□□□ 1.45
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SH3BP2-204ENST00000452765 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 FEZ1Q99689 392 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 TRAK2O60296 914 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 BMP3P12645 472 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.454e-7■■■■■ 30.7
SH3BP2-204ENST00000452765 NLRP5P59047 1200 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT85P78386 507 aa24.09■■□□□ 1.45
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