RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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VSX1-205ENST00000429762 CCDC96Q2M329 555 aa25.46■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.46■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.46■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 KRT2P35908 639 aa25.45■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 NPY5RQ15761 445 aa25.45■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
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VSX1-205ENST00000429762 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.45■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.45■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.45■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.45■■□□□ 1.67
VSX1-205ENST00000429762 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
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VSX1-205ENST00000429762 SNHG28P0DPA3 235 aa25.45■■□□□ 1.66
VSX1-205ENST00000429762 KCTD1Q719H9 257 aa25.45■■□□□ 1.66
VSX1-205ENST00000429762 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.45■■□□□ 1.66
VSX1-205ENST00000429762 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.45■■□□□ 1.66
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VSX1-205ENST00000429762 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.45■■□□□ 1.66
VSX1-205ENST00000429762 ME1P48163 572 aa25.44■■□□□ 1.66
VSX1-205ENST00000429762 NLRP5P59047 1200 aa25.44■■□□□ 1.66
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VSX1-205ENST00000429762 RNF181Q9P0P0 153 aa25.44■■□□□ 1.66
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VSX1-205ENST00000429762 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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VSX1-205ENST00000429762 H7C1D1 291 aa25.42■■□□□ 1.66
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VSX1-205ENST00000429762 A0A1W2PRG0 241 aa25.41■■□□□ 1.66
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VSX1-205ENST00000429762 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.4■■□□□ 1.66
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VSX1-205ENST00000429762 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.4■■□□□ 1.66
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VSX1-205ENST00000429762 SLC39A14Q15043 492 aa25.38■■□□□ 1.65
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VSX1-205ENST00000429762 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.37■■□□□ 1.65
VSX1-205ENST00000429762 USP17L10C9JJH3 530 aa25.37■■□□□ 1.65
VSX1-205ENST00000429762 NDUFB10O96000 172 aa25.37■■□□□ 1.65
VSX1-205ENST00000429762 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.37■■□□□ 1.65
VSX1-205ENST00000429762 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.37■■□□□ 1.65
VSX1-205ENST00000429762 FSD2A1L4K1 749 aa25.36■■□□□ 1.65
VSX1-205ENST00000429762 SMARCA1P28370 1054 aa25.36■■□□□ 1.65
VSX1-205ENST00000429762 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
VSX1-205ENST00000429762 NAPAP54920 295 aa25.36■■□□□ 1.65
VSX1-205ENST00000429762 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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