RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.67■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FANCBQ8NB91 859 aa15.67■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.67■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa15.67■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.67■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MTMR7Q9Y216 660 aa15.67■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PLA2G6O60733 806 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PFKFB2O60825 505 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GNAQP50148 359 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 INHBEP58166 350 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DGKZQ13574 1117 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MOGSQ13724 837 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ME3Q16798 604 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RTN1Q16799 776 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC96Q2M329 555 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP17L15C9J2P7 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP17L11C9JVI0 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP17L18D6R9N7 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP17L22D6RA61 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP17L19D6RCP7 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP17L20D6RJB6 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LARGE1O95461 756 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RXRAP19793 462 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP17L24Q0WX57 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.65■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 28.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCL15Q16663 113 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KCTD1Q719H9 257 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMX3Q96JJ7 454 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CAPNS2Q96L46 248 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FEM1BQ9UK73 627 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KLRF2D3W0D1 207 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STAT2P52630 851 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SREBF2Q12772 1141 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STK3Q13188 491 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TREML2Q5T2D2 321 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM160B2Q86V87 743 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HSCBQ8IWL3 235 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CHURC1Q8WUH1 139 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GTF3C6Q969F1 213 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BTBD19C9JJ37 291 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMEM232C9JQI7 657 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SMARCA1P28370 1054 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CDC27P30260 824 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SCRN1Q12765 414 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MYPNQ86TC9 1320 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FLOT1O75955 427 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MAP2K2P36507 400 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TM4SF4P48230 202 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HTRA3P83110 453 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GRM1Q13255 1194 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PNMA3Q9UL41 463 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.9 ms