RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363143.1

RNU6-623P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 623, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-623P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-623P-201ENST00000363143 GMIPQ9P107 970 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 TMEM82A0PJX8 343 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 RAG1P15918 1043 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZPBP2Q6X784 338 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF605Q86T29 641 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 ATG4CQ96DT6 458 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 TCTN2Q96GX1 697 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-623P-201ENST00000363143 SEZ6Q53EL9 994 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 GIPC2Q8TF65 315 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 GCM1Q9NP62 436 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 GGT7Q9UJ14 662 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 GPR160Q9UJ42 338 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 BBS9Q3SYG4 887 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 NLRX1Q86UT6 975 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SGPP1Q9BX95 441 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 LINC00310P59036 64 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 CHRNEQ04844 493 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 DUSP4Q13115 394 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 GK5Q6ZS86 529 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 TMEM192Q8IY95 271 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRAMEF1O95521 474 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 RNF4P78317 190 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 DLG4P78352 724 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 MLECQ14165 292 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SNX17Q15036 470 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 MAP6Q96JE9 813 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 TCFL5Q9UL49 500 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 PEX10O60683 326 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 FKTNO75072 461 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SYPP08247 313 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 PDE6BP35913 854 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 KIR3DS1Q14943 382 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SDHBP21912 280 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 APOBRQ0VD83 1088 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLC9A7Q96T83 725 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 SIGLEC6O43699 453 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 NRDCO43847 1150 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 NUAK1O60285 661 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 CLEC3AO75596 197 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 CTSKP43235 329 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 CHMP4BP1P59074 171 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-623P-201ENST00000363143 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 TNFRSF10CO14798 259 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 ACRP10323 421 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 MCM4P33991 863 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 SSPNQ14714 243 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 ADGRF1Q5T601 910 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLC6A18Q96N87 628 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 MEIS1O00470 390 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-623P-201ENST00000363143 SEMA7AO75326 666 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms