RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 GAB4Q2WGN9 574 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TP53INP2Q8IXH6 220 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABI1Q8IZP0 508 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 C8orf37Q96NL8 207 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 SHOXO15266 292 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP2R5EQ16537 467 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 AGBL5Q8NDL9 886 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 HDAC8Q9BY41 377 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHB10Q9UN67 800 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZP2Q05996 745 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCL1Q15111 1095 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCAF15Q66K64 600 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CREG2Q8IUH2 290 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHL6Q8WZ60 621 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 DUSP13Q9UII6 198 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 MINPP1Q9UNW1 487 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CBFA2T2O43439 604 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 SIGLEC6O43699 453 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRAMEF1O95521 474 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 BBS9Q3SYG4 887 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNPTABQ3T906 1256 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CBLL1Q75N03 491 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTSKP43235 329 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF445P59923 1031 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC7A5Q01650 507 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 EGR3Q06889 387 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNNI3KQ59H18 835 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 VHLLQ6RSH7 139 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 USHBP1Q8N6Y0 703 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRN4CLQ8ND94 238 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TCTN2Q96GX1 697 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 HAUS7Q99871 368 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 GP6Q9HCN6 339 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHST7Q9NS84 486 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR13Q9NZ81 148 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 B2RBV5 119 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 MEIS1O00470 390 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLF4O43474 513 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 EPHX1P07099 455 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD247P20963 164 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 LTKP29376 864 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEKQ02763 1124 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 BRF1Q92994 677 aa4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms