RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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SPNS1-204ENST00000352260 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
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SPNS1-204ENST00000352260 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
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SPNS1-204ENST00000352260 PFKFB1P16118 471 aa21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 NPY5RQ15761 445 aa21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 CABP5Q9NP86 173 aa21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 ERICH4A6NGS2 130 aa21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 NOVP48745 357 aa21.17■□□□□ 0.98
SPNS1-204ENST00000352260 CLCN6P51797 869 aa21.17■□□□□ 0.98
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