RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 FANCBQ8NB91 859 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 C8orf76Q96K31 380 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 DTNBO60941 627 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 POLD1P28340 1107 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 IARSP41252 1262 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 LEKR1Q6ZMV7 388 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 FBXW7Q969H0 707 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 MAP3K14Q99558 947 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 TCHHQ07283 1943 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 DPEP1P16444 411 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 CFAP45Q9UL16 551 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 C21orf2O43822 256 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 PRDM1O75626 825 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 NEBLO76041 1014 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 MYH1P12882 1939 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 TSPY2A6NKD2 308 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 FERMT3Q86UX7 667 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 SCN9AQ15858 1988 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 H0YHG0 523 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 SARNPP82979 210 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 AOC3Q16853 763 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 MKNK2Q9HBH9 465 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA3-201ENST00000317201 FIBPO43427 364 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 TROAPQ12815 778 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 BRAPQ7Z569 592 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 TTC6Q86TZ1 520 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 CRKP46108 304 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 PLCD1P51178 756 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 EVX2Q03828 476 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 NBPF11Q86T75 865 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 MYL10Q9BUA6 226 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 PPIP5K2O43314 1243 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 RXRAP19793 462 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 ALG1Q9BT22 464 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 USP40Q9NVE5 1235 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 PIM2Q9P1W9 311 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 INHBEP58166 350 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 TFAP4Q01664 338 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 CEP89Q96ST8 783 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 DEXIO95424 95 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 RASA1P20936 1047 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 CAMK4Q16566 473 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 MXD3Q9BW11 206 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 F8W031 263 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 CDK8P49336 464 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 FAM47AQ5JRC9 791 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 SWAP70Q9UH65 585 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 PAX7P23759 505 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 NOVP48745 357 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 IDI2Q9BXS1 227 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 TSPY3P0CV98 308 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 TSPY8P0CW00 308 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 CORO7P57737 925 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 GABPAQ06546 454 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 PHKBQ93100 1093 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 SPATA32Q96LK8 384 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA3-201ENST00000317201 SLC26A6Q9BXS9 759 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms