RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 GH2P01242 217 aa18.82■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PSEN1P49768 467 aa18.82■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 NID2Q14112 1375 aa18.82■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 TOP1P11387 765 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PKN1Q16512 942 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 VAT1LQ9HCJ6 419 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 MYH4Q9Y623 1939 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 ABCB5Q2M3G0 1257 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 GPC2Q8N158 579 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 SIAH1Q8IUQ4 282 aa18.81■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 TTLL1O95922 423 aa18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 RCAN1P53805 252 aa18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 CYTH3O43739 400 aa18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 GRM4Q14833 912 aa18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.79■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 CLGNO14967 610 aa18.79■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.79■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 KLRF2D3W0D1 207 aa18.79■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC17Q96LX7 622 aa18.79■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.79■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 DEXIO95424 95 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PTMSP20962 102 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 KIF5BP33176 963 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 SLC20A2Q08357 652 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 FAM83AQ86UY5 434 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 NOVP48745 357 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 TEPSINQ96N21 525 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 ADAMTS3O15072 1205 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PDHBP11177 359 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PPP2R5BQ15173 497 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 KCTD1Q719H9 257 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 GPT2Q8TD30 523 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 OXER1Q8TDS5 423 aa18.78■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.77■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 STK36Q9NRP7 1315 aa18.77■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 BTBD18B2RXH4 712 aa18.77■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 FAM193AP78312 1265 aa18.77■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM29Q14134 588 aa18.77■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 HOMER1Q86YM7 354 aa18.77■□□□□ 0.6
CHTF18-202ENST00000317063 SLC16A2P36021 539 aa18.77■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 ICA1Q05084 483 aa18.77■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 ECE1P42892 770 aa18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 NR5A1Q13285 461 aa18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 A0A1W2PRG0 241 aa18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 TNNI2P48788 182 aa18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 GGA3Q9NZ52 723 aa18.76■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 NT5C2P49902 561 aa18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM179Q6ZVK1 233 aa18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 ACER1Q8TDN7 264 aa18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 USP28Q96RU2 1077 aa18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 KRT85P78386 507 aa18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 CABP5Q9NP86 173 aa18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 PRKG1Q13976 671 aa18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 WASF1Q92558 559 aa18.75■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC96Q2M329 555 aa18.74■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.74■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 MMP1P03956 469 aa18.74■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.74■□□□□ 0.59
CHTF18-202ENST00000317063 SCG2P13521 617 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms