RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 BMP3P12645 472 aa26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 TROAPQ12815 778 aa26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 SGMS1Q86VZ5 419 aa26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF654Q8IZM8 581 aa26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 TMTC2Q8N394 836 aa26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 NUP133Q8WUM0 1156 aa26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 LOC285556D6RIA3 1793 aa26■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.99■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.99■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 USP17L15C9J2P7 530 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 USP17L11C9JVI0 530 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 USP17L18D6R9N7 530 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 USP17L22D6RA61 530 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 USP17L19D6RCP7 530 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 USP17L20D6RJB6 530 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 TRPA1O75762 1119 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 SNHG28P0DPA3 235 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 USP17L24Q0WX57 530 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC96Q2M329 555 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 TMEM232C9JQI7 657 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 CPVLQ9H3G5 476 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 RNF186Q9NXI6 227 aa25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 PEX10O60683 326 aa25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 FLOT1O75955 427 aa25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 APOA5Q6Q788 366 aa25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 FBXL16Q8N461 479 aa25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 DCAF4Q8WV16 495 aa25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC16A2P36021 539 aa25.96■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 AK2P54819 239 aa25.96■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF543Q08ER8 600 aa25.96■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.96■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 MICU3Q86XE3 530 aa25.96■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 CRHR2Q13324 411 aa25.96■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.96■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 TBC1D8O95759 1140 aa25.95■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.95■■□□□ 1.75
SOHLH1-201ENST00000298466 OSBPP22059 807 aa25.95■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 COG2Q14746 738 aa25.95■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 KIFC2Q96AC6 838 aa25.94■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.94■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 TSKSQ9UJT2 592 aa25.94■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 STAT2P52630 851 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 HERVK_113P62684 666 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 WBP1LQ9NX94 342 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 PNMA3Q9UL41 463 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 CA12O43570 354 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 DDAH1O94760 285 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 ALDH1A1P00352 501 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 RABEP1Q15276 862 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 JMYQ8N9B5 988 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 ATG4CQ96DT6 458 aa25.93■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 ZBTB43O43298 467 aa25.92■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 GRM4Q14833 912 aa25.92■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.92■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 FEM1BQ9UK73 627 aa25.92■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.92■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.92■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 DSG3P32926 999 aa25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 SNAP25P60880 206 aa25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 NBPF11Q86T75 865 aa25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 FANCBQ8NB91 859 aa25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 CPA4Q9UI42 421 aa25.91■■□□□ 1.74
SOHLH1-201ENST00000298466 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.91■■□□□ 1.74
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