RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 TTC38Q5R3I4 469 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 FERMT2Q96AC1 680 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 BARHL2Q9NY43 387 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 M0R2N6 131 aa24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP2B1P20020 1258 aa24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRP12P59046 1061 aa24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PLCB2Q00722 1185 aa24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 GRIN1Q05586 938 aa24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PIM2Q9P1W9 311 aa24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 POLD1P28340 1107 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 CFAP100Q494V2 611 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 STXBP3O00186 592 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 TTLL1O95922 423 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 LONRF3Q496Y0 759 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 SARM1Q6SZW1 724 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 MTFR1LQ9H019 292 aa24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ENTPD3O75355 529 aa24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB7AO95365 584 aa24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 SNHG28P0DPA3 235 aa24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 CNNM3Q8NE01 707 aa24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 MTMR7Q9Y216 660 aa24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 WNT7AO00755 349 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 PDHBP11177 359 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 CACNB3P54284 484 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 CSRNP2Q9H175 543 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 TCP10Q12799 353 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 DPCR1Q3MIW9 517 aa24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 SPECC1Q5M775 1068 aa24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 GMLQ99445 158 aa24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 COL4A5P29400 1685 aa24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 BECN2A8MW95 431 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 PSMD14O00487 310 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTS3O15072 1205 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF174Q15697 407 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 DNAJC18Q9H819 358 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A087WWV3 80 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 USP17L5A8MUK1 530 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 KANK3Q6NY19 840 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 TPM3P06753 285 aa24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF75DP51815 510 aa24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 PTGDRQ13258 359 aa24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 NIM1KQ8IY84 436 aa24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 RAD17O75943 681 aa24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 PNOCQ13519 176 aa24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
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