RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 TMX2Q9Y320 296 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 NDUFB10O96000 172 aa22.14■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.14■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 MCTP1Q6DN14 999 aa22.14■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.14■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.14■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 SLFN13Q68D06 897 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 KCTD1Q719H9 257 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 WASF1Q92558 559 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.13■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 MMP1P03956 469 aa22.12■■□□□ 1.13
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IFRD1-201ENST00000005558 POTEJP0CG39 1038 aa22.12■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 SCG2P13521 617 aa22.12■■□□□ 1.13
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IFRD1-201ENST00000005558 KLRG1Q96E93 195 aa22.12■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.12■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.12■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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IFRD1-201ENST00000005558 DCAF4Q8WV16 495 aa22.11■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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IFRD1-201ENST00000005558 GMCL1Q96IK5 515 aa22.11■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.11■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 SLC16A2P36021 539 aa22.1■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 PIGSQ96S52 555 aa22.1■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 DCAF15Q66K64 600 aa22.1■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.1■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.135e-7■□□□□ 10.7
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IFRD1-201ENST00000005558 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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IFRD1-201ENST00000005558 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.09■■□□□ 1.13
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IFRD1-201ENST00000005558 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.09■■□□□ 1.13
IFRD1-201ENST00000005558 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.09■■□□□ 1.13
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IFRD1-201ENST00000005558 VCPKMTQ9H867 229 aa22.08■■□□□ 1.12
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IFRD1-201ENST00000005558 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.06■■□□□ 1.12
IFRD1-201ENST00000005558 FAM205CA6NFA0 338 aa22.05■■□□□ 1.12
IFRD1-201ENST00000005558 M0R2N6 131 aa22.05■■□□□ 1.12
IFRD1-201ENST00000005558 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
IFRD1-201ENST00000005558 TRIM29Q14134 588 aa22.05■■□□□ 1.12
IFRD1-201ENST00000005558 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.05■■□□□ 1.12
IFRD1-201ENST00000005558 HOMER1Q86YM7 354 aa22.05■■□□□ 1.12
IFRD1-201ENST00000005558 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
IFRD1-201ENST00000005558 RAD21O60216 631 aa22.04■■□□□ 1.12
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