RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 FOXP2O15409 715 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 RAD21O60216 631 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 TSPY3P0CV98 308 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 TSPY8P0CW00 308 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 FLT3LGP49771 235 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 RGS19P49795 217 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 ERVK-9P63128 1117 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 ERVK-24P63145 666 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 ZNF333Q96JL9 665 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 GABRQQ9UN88 632 aa26.59■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 GRK4P32298 578 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 COG2Q14746 738 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 ALX1Q15699 326 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 MGAMO43451 1857 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 PEX10O60683 326 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 NEFLP07196 543 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 TTC22Q5TAA0 569 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.58■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 FGAP02671 866 aa26.57■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 CCNA1P78396 465 aa26.57■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.57■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 LBX2Q6XYB7 198 aa26.57■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 NYAP2Q9P242 653 aa26.57■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 FLOT1O75955 427 aa26.56■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 MAPK4P31152 587 aa26.56■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.56■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 Q3C1V9 767 aa26.56■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 SLAIN1Q8ND83 568 aa26.56■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 MYCP01106 439 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 TFAP4Q01664 338 aa26.55■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.55■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.55■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 ADCY3O60266 1144 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 IRF5Q13568 498 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 CEP95Q96GE4 821 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 ZMYM6O95789 1325 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 TTLL1O95922 423 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 UBXN2AP68543 259 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.54■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.53■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 TSPY2A6NKD2 308 aa26.53■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 PXYLP1Q8TE99 480 aa26.53■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 TOMM22Q9NS69 142 aa26.53■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 DSG3P32926 999 aa26.52■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.52■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.52■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 MB21D1Q8N884 522 aa26.52■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 PORCNQ9H237 461 aa26.52■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
SYT6-210ENST00000641643 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.51■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 CNMDO75829 334 aa26.51■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 WDR78Q5VTH9 848 aa26.51■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.51■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 BTBD7Q9P203 1132 aa26.51■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 GJD2Q9UKL4 321 aa26.51■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 F5H6K3 240 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 KLRC3Q07444 240 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 GPR142Q7Z601 462 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 SOCS4Q8WXH5 440 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 MKL1Q969V6 931 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 INCENPQ9NQS7 918 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 POTEFA5A3E0 1075 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 ELNP15502 786 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 HAND2P61296 217 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHH3Q7Z736 793 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 BRCA2P51587 3418 aa26.5■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 ORC4O43929 436 aa26.49■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 ATG4CQ96DT6 458 aa26.49■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 STX8Q9UNK0 236 aa26.49■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 NDUFB10O96000 172 aa26.48■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 FGRP09769 529 aa26.48■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 PLS1Q14651 629 aa26.48■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 MTFR1Q15390 333 aa26.48■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.48■■□□□ 1.83
SYT6-210ENST00000641643 ZNF213O14771 459 aa26.47■■□□□ 1.83
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