RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640499.1

VEGFA-231, Transcript of vascular endothelial growth factor A, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L15	C9J2P7	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L11	C9JVI0	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L18	D6R9N7	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L22	D6RA61	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L19	D6RCP7	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L20	D6RJB6	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF213	O14771	459 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	HERVK_113	P62684	666 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L24	Q0WX57	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		31.65	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	NOV	P48745	357 aa		31.64	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		31.64	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		31.64	■■■□□ 2.66
VEGFA-231	ENST00000640499	MYH4	Q9Y623	1939 aa		31.63	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	SH2D4A	Q9H788	454 aa		31.63	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		31.63	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	TRIM17	Q9Y577	477 aa		31.63	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	NEDD4	P46934	1319 aa		31.63	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	TSPY2	A6NKD2	308 aa		31.62	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		31.62	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	LPAR1	Q92633	364 aa		31.62	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	TTLL1	O95922	423 aa		31.61	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	MAP4K1	Q92918	833 aa		31.61	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	TRIM47	Q96LD4	638 aa		31.61	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	EFCC1	Q9HA90	598 aa		31.61	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		31.61	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		31.61	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	CNMD	O75829	334 aa		31.6	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		31.6	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499		Q3C1V9	767 aa		31.6	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	HTT	P42858	3142 aa		31.6	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	MGAM	O43451	1857 aa		31.59	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	PARP14	Q460N5	1801 aa		31.59	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499		F5H6K3	240 aa		31.59	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	PSMC4	P43686	418 aa		31.59	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	KLRC3	Q07444	240 aa		31.59	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	TOMM22	Q9NS69	142 aa		31.59	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	NDUFB10	O96000	172 aa		31.58	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	CYP21A2	P08686	494 aa		31.58	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		31.58	■■■□□ 2.65
VEGFA-231	ENST00000640499	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	LBX2	Q6XYB7	198 aa		31.57	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		31.57	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	GOPC	Q9HD26	462 aa		31.57	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	CDC45	O75419	566 aa		31.56	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	COG2	Q14746	738 aa		31.56	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		31.56	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		31.56	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	ABHD8	Q96I13	439 aa		31.56	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		31.56	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		31.56	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		31.56	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	KIF22	Q14807	665 aa		31.55	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		31.55	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	BTBD7	Q9P203	1132 aa		31.55	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		31.54	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499		B4E1Z4	1266 aa		31.54	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	DSG3	P32926	999 aa		31.54	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	STX8	Q9UNK0	236 aa		31.54	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	RAD21	O60216	631 aa		31.53	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	KDM4A	O75164	1064 aa		31.53	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		31.53	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		31.53	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		31.53	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		31.53	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		31.53	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499		A0A0G2JMZ2	1700 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	ERVK-9	P63128	1117 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	ERVK-24	P63145	666 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	ESR2	Q92731	530 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	ATG4C	Q96DT6	458 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		31.52	■■■□□ 2.64
VEGFA-231	ENST00000640499	FLOT1	O75955	427 aa		31.51	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	FCGRT	P55899	365 aa		31.51	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	SLFN13	Q68D06	897 aa		31.51	■■■□□ 2.63

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