RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	MYH8	P13535	1937 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RPS5-208	ENST00000599909	COL6A3	P12111	3177 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	CNGA1	P29973	690 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	CYBA	P13498	195 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	LPAR1	Q92633	364 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	DLL1	O00548	723 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	PRKAB2	O43741	272 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ERCC3	P19447	782 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ADORA2A	P29274	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	COG2	Q14746	738 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	MIER1	Q8N108	512 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	DNM1L	O00429	736 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	MSC	O60682	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	COBL	O75128	1261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	CHGB	P05060	677 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	AKR1B1	P15121	316 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	MBD4	O95243	580 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	DSG3	P32926	999 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ADD2	P35612	726 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	RTP1	P59025	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ICA1	Q05084	483 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	PLS1	Q14651	629 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	MYH7	P12883	1935 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	STRN	O43815	780 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	FLOT1	O75955	427 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS5-208	ENST00000599909	SEPT4	O43236	478 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	CDK8	P49336	464 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	MROH8	Q9H579	483 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	USP17L21	D6R901	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	HMMR	O75330	724 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ATP5J	P18859	108 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	HAUS7	Q99871	368 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPS5-208	ENST00000599909	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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