RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 LCORLQ8N3X6 602 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 MYLIPQ8WY64 445 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3D19Q5HYK7 790 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 ARMT1Q9H993 441 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX11Q8IYF3 940 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 USP6NLQ92738 828 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 PICALMQ13492 652 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 SHHQ15465 462 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFRSF10AO00220 468 aa28.08■■■□□ 2.09
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CAPNS1-214ENST00000592483 FOSL2P15408 326 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPK4P31152 587 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 C8orf34Q49A92 452 aa28.08■■■□□ 2.09
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CAPNS1-214ENST00000592483 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS2P41220 211 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L5A8MUK1 530 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL14Q16627 93 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMYM6O95789 1325 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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CAPNS1-214ENST00000592483 FOCADQ5VW36 1801 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 IL25Q9H293 177 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM196BA6NMK8 535 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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CAPNS1-214ENST00000592483 ALX1Q15699 326 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 MORN1Q5T089 497 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 AS3MTQ9HBK9 375 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 PEX10O60683 326 aa28.03■■■□□ 2.08
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CAPNS1-214ENST00000592483 GPR142Q7Z601 462 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-214ENST00000592483 APPP05067 770 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 RTP1P59025 263 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR18Q9BV38 432 aa28.01■■■□□ 2.07
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CAPNS1-214ENST00000592483 FRMPD3Q5JV73 1810 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 DNM1LO00429 736 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKAB2O43741 272 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 MSCO60682 206 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 BACE1P56817 501 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 Q3C1V9 767 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 IFNL3Q8IZI9 196 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 LPAR1Q92633 364 aa28■■■□□ 2.07
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CAPNS1-214ENST00000592483 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 NAV1Q8NEY1 1877 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.99■■■□□ 2.07
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CAPNS1-214ENST00000592483 ERVK-9P63128 1117 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 ERVK-24P63145 666 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 MTMR2Q13614 643 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS53Q5VIR6 699 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP4K1Q92918 833 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-214ENST00000592483 NAPBQ9H115 298 aa27.99■■■□□ 2.07
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