RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 PARP14Q460N5 1801 aa22.21■■□□□ 1.15
INO80E-212ENST00000568043 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.21■■□□□ 1.15
INO80E-212ENST00000568043 A0A1W2PRG0 241 aa22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 COBLO75128 1261 aa22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 ADORA2AP29274 412 aa22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 SEPT2Q15019 361 aa22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 SNX17Q15036 470 aa22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 BADQ92934 168 aa22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.2■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 GABPAQ06546 454 aa22.19■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 TRIM60Q495X7 471 aa22.19■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.19■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.19■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 DPP9Q86TI2 863 aa22.19■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.19■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 TTC6Q86TZ1 520 aa22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 TTC28Q96AY4 2481 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 ERCC3P19447 782 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 ITGB8P26012 769 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 COG2Q14746 738 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 MYLIPQ8WY64 445 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 CABP5Q9NP86 173 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 MYH8P13535 1937 aa22.16■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 SEPT4O43236 478 aa22.16■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 RLBP1P12271 317 aa22.16■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.16■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 FERMT2Q96AC1 680 aa22.16■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.15■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 KBTBD13C9JR72 458 aa22.15■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 STRNO43815 780 aa22.15■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 LRRC41Q15345 812 aa22.15■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 CERS3Q8IU89 383 aa22.15■■□□□ 1.14
INO80E-212ENST00000568043 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.14■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.14■■□□□ 1.13
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INO80E-212ENST00000568043 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.14■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 MUC3AQ02505 3323 aa22.14■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 EPHB4P54760 987 aa22.13■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.13■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.13■■□□□ 1.13
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INO80E-212ENST00000568043 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 TLE2Q04725 743 aa22.12■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 MAP3K12Q12852 859 aa22.12■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.12■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.12■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 MAML3Q96JK9 1138 aa22.12■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 MYO9BQ13459 2157 aa22.11■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 DSG3P32926 999 aa22.11■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 ATG4CQ96DT6 458 aa22.11■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 CYP2D6P10635 497 aa22.1■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.1■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.09■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 SMIM22K7EJ46 135 aa22.09■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 PLS1Q14651 629 aa22.09■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.09■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.09■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.09■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 MROH8Q9H579 483 aa22.09■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.09■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 PHF24Q9UPV7 400 aa22.09■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 MB21D1Q8N884 522 aa22.08■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.08■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.08■■□□□ 1.13
INO80E-212ENST00000568043 FLOT1O75955 427 aa22.07■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 FOSL2P15408 326 aa22.07■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 PDE6AP16499 860 aa22.07■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.07■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 CEP85Q6P2H3 762 aa22.07■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.06■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 PGK1P00558 417 aa22.06■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 CLTBP09497 229 aa22.06■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 AKR1B1P15121 316 aa22.06■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.06■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.06■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 AACSQ86V21 672 aa22.06■■□□□ 1.12
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