RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.74■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 STX8Q9UNK0 236 aa24.74■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 E7EWF7 191 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC27A2O14975 620 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSBPP22059 807 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 MKL1Q969V6 931 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOPCQ9HD26 462 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNMA3Q9UL41 463 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPA4Q9UI42 421 aa24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 LPAR1Q92633 364 aa24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L15C9J2P7 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L11C9JVI0 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L18D6R9N7 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L22D6RA61 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L19D6RCP7 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L20D6RJB6 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 F5H6K3 240 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLRC3Q07444 240 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L24Q0WX57 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRDNQ13061 729 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 REC8O95072 547 aa24.7■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.7■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 C17orf99Q6UX52 265 aa24.7■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.7■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 NDUFB10O96000 172 aa24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOVP48745 357 aa24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 FKTNO75072 461 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 NT5C2P49902 561 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQCA1Q86XH1 822 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCOA7Q8NI08 942 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 HERVK_113P62684 666 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 SP3Q02447 781 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF20Q5VTR2 975 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 RLFQ13129 1914 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTMR7Q9Y216 660 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARP14Q460N5 1801 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCRP11274 1271 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLFN13Q68D06 897 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 RASEFQ8IZ41 740 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC14Q96N46 770 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 PEX10O60683 326 aa24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHST3Q7LGC8 479 aa24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNKSO95271 1327 aa24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 FLOT1O75955 427 aa24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 COG2Q14746 738 aa24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 DGKHQ86XP1 1220 aa24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCCP23508 829 aa24.64■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.64■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.64■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSPA4P34932 840 aa24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAP1Q01518 475 aa24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANTXR2P58335 489 aa24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP26Q9BXU7 913 aa24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.1 ms