RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559373.1

TSPAN3-206, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN3, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-206ENST00000559373 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.71■■□□□ 1.55
TSPAN3-206ENST00000559373 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.71■■□□□ 1.55
TSPAN3-206ENST00000559373 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.7■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.7■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.7■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.7■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.7■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 CDK8P49336 464 aa24.69■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 C12orf60Q5U649 245 aa24.69■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 CCNA1P78396 465 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 ATP2B2Q01814 1243 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 MAP2K5Q13163 448 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 UBE3CQ15386 1083 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 APBA2Q99767 749 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 SWAP70Q9UH65 585 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 PTPREP23469 700 aa24.67■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 ICA1Q05084 483 aa24.67■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 CTR9Q6PD62 1173 aa24.67■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.67■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.67■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 COG2Q14746 738 aa24.66■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 DCTPP1Q9H773 170 aa24.66■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 STAP2Q9UGK3 403 aa24.66■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.66■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.66■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 PLS1Q14651 629 aa24.65■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 LBX2Q6XYB7 198 aa24.65■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.65■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 NBPF3Q9H094 633 aa24.65■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.65■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 RAD21O60216 631 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPAN3-206ENST00000559373 FLOT1O75955 427 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 SYN1P17600 705 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 CYP2C19P33261 490 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 LHX8Q68G74 356 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 OSBP2Q969R2 916 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 ATG4CQ96DT6 458 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 TMX2Q9Y320 296 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 PFASO15067 1338 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 CNGA1P29973 690 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 GRB14Q14449 540 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 PRO3102Q9H379 93 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 VCPKMTQ9H867 229 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 ERCC3P19447 782 aa24.61■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 DSG3P32926 999 aa24.61■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.61■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 CCDC17Q96LX7 622 aa24.61■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 MCM3APO60318 1980 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 M0R2C6 588 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 CAPN2P17655 700 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 ADORA2AP29274 412 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 DPP9Q86TI2 863 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 ANO1Q5XXA6 986 aa24.59■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 TRPV1Q8NER1 839 aa24.59■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 GPATCH3Q96I76 525 aa24.59■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 COBLO75128 1261 aa24.58■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 LPAR1Q92633 364 aa24.58■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
TSPAN3-206ENST00000559373 LAMA3Q16787 3333 aa24.58■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.57■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 APPBP2Q92624 585 aa24.57■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 SH2D4AQ9H788 454 aa24.57■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 GPAA1O43292 621 aa24.56■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 APPP05067 770 aa24.56■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 RASA1P20936 1047 aa24.56■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.56■■□□□ 1.52
TSPAN3-206ENST00000559373 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms