RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.79■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.79■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 IRF5Q13568 498 aa28.78■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 ERVK-9P63128 1117 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 ERVK-24P63145 666 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 UBXN2AP68543 259 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 PXYLP1Q8TE99 480 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 MGAMO43451 1857 aa28.76■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.76■■■□□ 2.2
PITX3-202ENST00000539804 TTLL1O95922 423 aa28.76■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 GRK4P32298 578 aa28.76■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 CAP1Q01518 475 aa28.76■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 PRKCZQ05513 592 aa28.76■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.76■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.76■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 SOCS4Q8WXH5 440 aa28.76■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 NEFLP07196 543 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 CAPN2P17655 700 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 CTGFP29279 349 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
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PITX3-202ENST00000539804 PAGR1Q9BTK6 254 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.75■■■□□ 2.19
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PITX3-202ENST00000539804 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.74■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.74■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 RAD50Q92878 1312 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 TSPY2A6NKD2 308 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 SMIM22K7EJ46 135 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 PRDM1O75626 825 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 PDE4AP27815 886 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 FLT3LGP49771 235 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 TFAP4Q01664 338 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 VPS53Q5VIR6 699 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
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PITX3-202ENST00000539804 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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PITX3-202ENST00000539804 FLOT1O75955 427 aa28.72■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.72■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa28.71■■■□□ 2.19
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PITX3-202ENST00000539804 RAD21O60216 631 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 SOX10P56693 466 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX3-202ENST00000539804 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.71■■■□□ 2.19
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PITX3-202ENST00000539804 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 CEP95Q96GE4 821 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 ZNF213O14771 459 aa28.69■■■□□ 2.18
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PITX3-202ENST00000539804 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 TOMM22Q9NS69 142 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 F5H6K3 240 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 COPB2P35606 906 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 KLRC3Q07444 240 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 GABRQQ9UN88 632 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
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PITX3-202ENST00000539804 RGS2P41220 211 aa28.66■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
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PITX3-202ENST00000539804 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.66■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.66■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 GPR142Q7Z601 462 aa28.66■■■□□ 2.18
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PITX3-202ENST00000539804 SLC25A27O95847 323 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 FDX1P10109 184 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 MROH8Q9H579 483 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 GJD2Q9UKL4 321 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX3-202ENST00000539804 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.65■■■□□ 2.18
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