RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	IRF5	Q13568	498 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	FLOT1	O75955	427 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	MGAM	O43451	1857 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL1	O95922	423 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SDS	P20132	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	RASA1	P20936	1047 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	COPB2	P35606	906 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	RGS2	P41220	211 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	NT5C2	P49902	561 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	PLS1	Q14651	629 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	PRDM1	O75626	825 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	TFAP4	Q01664	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	ALX1	Q15699	326 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PRG0	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF213	O14771	459 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGCR	P04035	888 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	EVX2	Q03828	476 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0D9SFI3	127 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	STRN	O43815	780 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A27	O95847	323 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2B6	P20813	491 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CTGF	P29279	349 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	DSG3	P32926	999 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	MROH8	Q9H579	483 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246		F5H6K3	240 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBED4	O75132	1171 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	INHA	P05111	366 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	FDX1	P10109	184 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CCL5	P13501	91 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	KLRC3	Q07444	240 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-231	ENST00000496246	FGA	P02671	866 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-231	ENST00000496246	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-231	ENST00000496246	GJB1	P08034	283 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-231	ENST00000496246	ELN	P15502	786 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-231	ENST00000496246	CAP1	Q01518	475 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-231	ENST00000496246	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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