RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.221e-56■■■■■ 29.5
RABGGTB-208ENST00000471759 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CROTQ9UKG9 612 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 RAB21Q9UL25 225 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PNMA2Q9UL42 364 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SSH2Q76I76 1423 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 A6NHS1 94 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP4AP20648 1035 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ALDH3A1P30838 453 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 KIF5BP33176 963 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 HSPA4P34932 840 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 BLMHQ13867 455 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 GNPTABQ3T906 1256 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 HOOK3Q86VS8 718 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 EVI5LQ96CN4 794 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 OPTNQ96CV9 577 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CLIC6Q96NY7 704 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.225e-30■□□□□ 9.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 EBF2Q9HAK2 575 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CBX8Q9HC52 389 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFATQ9P243 1243 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA0232Q92628 1395 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PLSCR1O15162 318 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CASP8Q14790 479 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 RCN1Q15293 331 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 RSPH3Q86UC2 560 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MFRPQ9BY79 579 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR37O15354 613 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 P4HA2O15460 535 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SH3BP5O60239 455 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMC4P43686 418 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 AMPHP49418 695 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CUL4AQ13619 759 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNN1Q92952 543 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 STK32BQ9NY57 414 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC37A3O60309 1634 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFAB1O14561 156 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CYP27B1O15528 508 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 NPTXRO95502 500 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 BCRP11274 1271 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 USP11P51784 963 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 ARPC4P59998 168 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MXRA7P84157 204 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MECOMQ03112 1051 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CBX3Q13185 183 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 MAP7Q14244 749 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-208ENST00000471759 CHRNA2Q15822 529 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 725 ms