RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 NYAP2Q9P242 653 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 ASNSP08243 561 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 KIF5BP33176 963 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 WRNIP1Q96S55 665 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 GRM4Q14833 912 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 DOCK1Q14185 1865 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 TRAF5O00463 557 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 RAD21O60216 631 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 INPP5BP32019 993 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 PHKBQ93100 1093 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 MAP3K14Q99558 947 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-201ENST00000360046 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 NTRK3Q16288 839 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 MKL1Q969V6 931 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 IFNAR1P17181 557 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 KLRG1Q96E93 195 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 KIF3AQ9Y496 699 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 USP17L5A8MUK1 530 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 CHADLQ6NUI6 762 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 PDHBP11177 359 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 GINM1Q9NU53 330 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 PDCP20941 246 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 PKP1Q13835 747 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 MYH6P13533 1939 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1W2PRG0 241 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 SYT1P21579 422 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 ECE1P42892 770 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 GNAQP50148 359 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 NUCB2P80303 420 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 ACER1Q8TDN7 264 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 PICK1Q9NRD5 415 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 SH2D4AQ9H788 454 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 FOSBP53539 338 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 MAP3K9P80192 1104 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC96Q2M329 555 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 SLFN13Q68D06 897 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 MOB2Q70IA6 237 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 NBPF11Q86T75 865 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 STK36Q9NRP7 1315 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXA4-201ENST00000360046 KLRF2D3W0D1 207 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 STX6O43752 255 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 SNHG28P0DPA3 235 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 FEZ1Q99689 392 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 TMX2Q9Y320 296 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 OTOFQ9HC10 1997 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 F5H6K3 240 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 KLRC3Q07444 240 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 FUT2Q10981 343 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-201ENST00000360046 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms