RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283882.3

CFDP1-201, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFDP1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-201ENST00000283882 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 WASF1Q92558 559 aa14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 CABP5Q9NP86 173 aa14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 GGA3Q9NZ52 723 aa14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 SNHG28P0DPA3 235 aa14.53□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 RXRAP19793 462 aa14.53□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 SMARCA1P28370 1054 aa14.53□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 FUT2Q10981 343 aa14.53□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.53□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 MTMR6Q9Y217 621 aa14.53□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.52□□□□□ -0.08
CFDP1-201ENST00000283882 FAM196BA6NMK8 535 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 DEXIO95424 95 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 GUCY1A2P33402 732 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 CAP2P40123 477 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ICA1Q05084 483 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PKP1Q13835 747 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 NBPF11Q86T75 865 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 DDX11Q96FC9 970 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 MYH4Q9Y623 1939 aa14.52□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 GH2P01242 217 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ASNSP08243 561 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 EPHX2P34913 555 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 GBP4Q96PP9 640 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.51□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 GDF11O95390 407 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 F13A1P00488 732 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SLURP2P0DP57 97 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PDHBP11177 359 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SEPT2Q15019 361 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 DCAF4Q8WV16 495 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SH2D4AQ9H788 454 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.5□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 DOCK1Q14185 1865 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 H3BQV1 296 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 IFFO2Q5TF58 517 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SULF1Q8IWU6 871 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PHKBQ93100 1093 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 GMCL1Q96IK5 515 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 C8orf76Q96K31 380 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ALG1Q9BT22 464 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.49□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.48□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 JAG1P78504 1218 aa14.48□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF543Q08ER8 600 aa14.48□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.48□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.48□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 TMX2Q9Y320 296 aa14.48□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 MYH6P13533 1939 aa14.47□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 XBP1P17861 261 aa14.47□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 PTMSP20962 102 aa14.47□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 TRIM29Q14134 588 aa14.47□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CFDP1-201ENST00000283882 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms