RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 DPP9Q86TI2 863 aa20.33■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PQY0 241 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 LDHCP07864 332 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 GSTO1P78417 241 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 WDR63Q8IWG1 891 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 TOX2Q96NM4 488 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 TBX21Q9UL17 535 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.32■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 COBLO75128 1261 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 TIMP1P01033 207 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 VCAM1P19320 739 aa20.31■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD5Q6N075 450 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.3■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 FLT1P17948 1338 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 STRNO43815 780 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 GPR37L1O60883 481 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 RAB30Q15771 203 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 AAK1Q2M2I8 961 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 FEZ1Q99689 392 aa20.29■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 GH2P01242 217 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 TIMM10P62072 90 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 PI16Q6UXB8 463 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.28■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 ERC2O15083 957 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 PGK1P00558 417 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 RARBP10826 455 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 RNF180Q86T96 592 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 MAML3Q96JK9 1138 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 MSRAQ9UJ68 235 aa20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPCS1-201ENST00000233025 CACNA1AO00555 2505 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 USP14P54578 494 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC174Q6PII3 467 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 XAGE2Q96GT9 111 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 PALD1Q9ULE6 856 aa20.26■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 CSF2RAP15509 400 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 ERCC3P19447 782 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF365Q70YC5 407 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 MRS2Q9HD23 443 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 RAI14Q9P0K7 980 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.25■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GUL7 405 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS4O75173 837 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA5Q8NB90 893 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 ACER1Q8TDN7 264 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 HERVK_113Q902F9 699 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRCP08575 1304 aa20.24■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 ACRP10323 421 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 MRE11P49959 708 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF521Q96K83 1311 aa20.23■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 TLL1O43897 1013 aa20.22■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 PLCG2P16885 1265 aa20.22■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 ACLYP53396 1101 aa20.22■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.22■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 COPRSQ9NQ92 184 aa20.22■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 MCM3APO60318 1980 aa20.22■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 PPP4CP60510 307 aa20.21■□□□□ 0.83
SPCS1-201ENST00000233025 BAG3O95817 575 aa20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 HLA-DOAP06340 250 aa20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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