RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 TREML2Q5T2D2 321 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 GNRH1P01148 92 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 EVX2Q03828 476 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM227BQ96M60 508 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 AKR1B1P15121 316 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 PDE4AP27815 886 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 HOXD10P28358 340 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 ICA1Q05084 483 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 TTC22Q5TAA0 569 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 C12orf42Q96LP6 360 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 A0A0D9SFI3 127 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 PTPRFP10586 1907 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 GUCY1A2P33402 732 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 PPARAQ07869 468 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 ADGRA2Q96PE1 1338 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L15C9J2P7 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L11C9JVI0 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L18D6R9N7 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L22D6RA61 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L19D6RCP7 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L20D6RJB6 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 CAPN15O75808 1086 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 BCRP11274 1271 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 PRMT2P55345 433 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 FCGRTP55899 365 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L24Q0WX57 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 ALX1Q15699 326 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 ACER1Q8TDN7 264 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 ATP2B2Q01814 1243 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 PSMC4P43686 418 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 LPAR1Q92633 364 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 MYH8P13535 1937 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 SMIM22K7EJ46 135 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 RASA1P20936 1047 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 VPS53Q5VIR6 699 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 TMX2Q9Y320 296 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 TSPY3P0CV98 308 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 TSPY8P0CW00 308 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 VCAM1P19320 739 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 GOPCQ9HD26 462 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC35A3-216ENST00000639221 ZMYM6O95789 1325 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 HERVK_113P62684 666 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 PRDM1O75626 825 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 FGAP02671 866 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 VCPKMTQ9H867 229 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 A0A1W2PRG0 241 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 NBPF11Q86T75 865 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 COA7Q96BR5 231 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 RAD21O60216 631 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 TRIM47Q96LD4 638 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 TOMM22Q9NS69 142 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-216ENST00000639221 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms